EM菌为一种混合菌一般包括光合菌、酵母菌、乳酸菌等等有益菌类。可用于食品添加，养殖病害防治，土壤改良、生根壮苗、污水治理等等
EM菌（Effective Microorganisms）是由大约80种微生物组成，EM菌由日本琉球大学的比嘉照夫教授1982 [1] 年研究成功，于80年代投入市场。EM菌是以光合细菌、乳酸菌、酵母菌和放线菌为主的10个属 80余个微生物复合而成的一 种微生活菌制剂。作用机理是形成EM菌和病原微生物争夺营养的竞争，由于em菌在土壤中极易生存繁殖，所以能较快而稳定地占据土壤中的生态地位，形成有益的微生物菌的优势群落，从而控制病原微生物的繁殖和对作物的侵袭。是生态农业的发展方向，更有利于农业的可持续发展。80年代末90年代初,EM菌已被日本、泰国、巴西、美国、印度尼西亚、斯里兰卡等国广泛应用于农业、养殖、种植、环保等领域，取得了明显的经济效益和生态效益。
