幽门螺杆菌（HP）感染是慢性胃炎的主要原因。
目前已经有较多的关于益生菌能否防治幽门螺杆菌感染的研究，但所得结论并不十分一致。益生菌属于厌氧菌，在上呼吸道有氧环境下的生物学特征和行为尚未完全明确，尤其益生菌在胃酸环境下不能长时间生存，自然不能发挥作用。
目前在临床应用方面还存在一些需要解决的问题和很多不确定的因素，如菌株的选择，剂量、疗程及如何与其它药物联合使用等，都有待于进一步的研究。
因此，虽然微生态疗法在抗感染、调节机体免疫机能，平衡肠道菌群，降低抗生素的副作用等多种生物学功能有很好的作用，但是目前益生菌对幽门螺杆菌（HP）长期抑制可靠性较低，没有可靠数据做保证，不建议使用。
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